15.2 嗜油菌的16S rDNA鉴定
15.2.1 16S rDNA序列分析
16S rDNA序列分析[403, 404]主要按照以下步骤。
(1) 采用生工SK1201-UNIQ-10柱式细菌基因组DNA抽提试剂盒提取基因组;
(2) 在16S rDNA基因的PCR扩增过程中,采用了如下的扩增条件和扩增的引物:
PCR扩增条件为:98℃预变性5min, 95℃变性35s, 55℃退火35s, 72℃延伸1min 30s, 35个循环,72℃延伸8min;
PCR扩增的引物是:P1正向引物为5′AGAGTTTGATCCTGGCTCAG 3′ 20bp, P2反向引物为5′ GGTTACCTTGTTACGACTT 3′ 19bp;
(3) PCR产物的回收。采用SK1131-UNIQ-10 DNA胶回收试剂盒纯化回收DNA片断;
(4) 采用SK2211-T-载体PCR产物克隆试剂盒目的片断TA克隆。
a. 连接反应:
1μL 10×Ligation Buffer
1μL 50%PEG
50ng pUCm-T Vector
0.2pmol PCR Product
xμL H ...... (共1404字) [阅读本文]>>