下面介绍以多单元均衡为出发点解水动力弥散方程的方法，这一方法借助于有限元的基函数直接从积分方程导出离散方程组，在数学上的处理十分简单而且能较好地保持局部和整体的质量守恒。这一方法不仅能用于承压含水层的情形，而且也能用于无压含水层以及饱和-非饱和流的情形，因此是一种很实用的方法。
3.2.5.1 基本方程
在饱和厚度可变的含水层中，二维溶质输运的方程为
式中 m——含水层的饱和厚度，它可以随位置和时间发生变化;
n——含水层的有效孔隙率;
W——对单位的含水层的注水流量或抽水流量，抽水为正，注水为负;
C——源或汇中所含的溶质浓度。
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