三、rRNA的序列及进化分析
rRNA在所有细胞中都会表达,因此可以通过对编码rRNA的基因进行测序来对某种微生物进行分类,计算出相关的种群或估测物种的差异度。当前rRNA序列测定和分析的方法主要采用的是20世纪80年代末发展起来的全序列分析法,而早前的寡核苷酸编目分析法由于其局限性已经被淘汰。随着基因测序手段的不断发展,越来越多的rRNA基因序列被测定,序列测定的结果被储存在特殊的数据库 (如RDP-Ⅱ、SILVA等) 中。截至2015年5月26日统计,RDP数据库中已储存有3224600条原核生物的16S rRNA序列和108901条真菌的28S rRNA序列。
在采用rRNA分子计时器进行微生物进化关系分析时,一般流程如下: ①对所比对的微生物进行培养; ...... (共1312字) [阅读本文]>>